Rede Nacional de Espectrometria de Massa
A Rede Portuguesa de Espectrometria de Massa (RNEM) é uma infra-estrutura nacional que fornece conhecimentos científicos especializados, tecnologia avançada, formação e serviços na área da espectrometria de massa e proteómica.
Incluída no Roteiro Português de Infraestruturas de Investigação Científica de Interesse Estratégico, a RNEM é atualmente constituída por 14 nós, entre os quais o CCMAR, que oferecem serviços diversificados, interdisciplinares e orientados para a resolução de problemas.
Espectrometria de Massa
No CCMAR, a Espectrometria de Massa está principalmente dedicada às Ciências do Mar e fornece apoio, formação e serviços, particularmente nas áreas de metabolómica, produtos naturais e toxinas e contaminantes marinhos
Equipamento MS
Orbitrap Elite, ITMS & FTMS, CID MSn, n até 10, e HCD, com exatidão < 5 ppm em modo full scan e fragmentação.
Fontes ESI e APCI disponíveis.
O equipamento permite:
- Introdução de amostras por infusão e UHPLC (Thermo Scientific ultimate 3000)
- Gama de m/z: 15 – 4000, com Trap Linear (ITMS)
- Gama de m/z: 50 – 4000, com Orbitrap (FTMS)
- Fragmentação por “Collision Induced Dissociation” (CID) MSn, n até 10
- Fragmentação por “Higher energy C-trap Dissociation” (HCD)
- Resolução: até 240 000 (@m/z 400)
- Exatidão: < 5 ppm em “full scan” e MSn
Aplicações:
- Metabolómica
- Produtos naturais
- Análise ambiental
- Análise de alimentos
GC-MS (Bruker)
O equipamento pode ser utilizado para análise de compostos voláteis e semi-voláteis.
Cromatografia líquida
UHPLC. Cromatógrafo de fase líquida Thermo Scientific, modelo Ultimate 3000. Detetores DAD e Fluorescência.
Cromatógrafo analítico/preparativo. Shimadzu. Equipado com bomba binária, amostrador automático, coletor de frações, e detetores DAD e ELSD.
Serviços:
- Metabolómica (“untargeted”)
- LC-MS. Aquisição em modo “data dependent” com cromatografia RP-18 e/ou HILIC.
- Processamento de dados. Com Compound Discoverer 3.3, workflows para metabolómica com estatística, identificação de compostos recorrendo a bases de dados locais e bases de dados online como por exemplo a mzCloud, a HMDB ou a BioCyc.
- Análise de biotoxinas marinhas:
- Toxinas DSP: ácido ocadáico (AO), dinofisistoxinas (DTX-1 e DTX-2), iessotoxinas (YTX, YTX-OH, h-YTX e h-YTX-OH)
- Toxinas AZP: azaspirácido-1 (AZA-1), azaspirácido-2 (AZA-2), azaspirácido-3 (AZA-3)
- Toxins PSP: saxitoxinas carbamato (STX e neoSTX), decarbamoil-saxitoxinas (dcSTX, dcneoSTX, dc-GTX-2 e dc-GTX-3), goniautoxinas (GTX-1, GTX-2, GTX-3 e GTX-4), N-sulfo-carbamoil saxitoxinas (C1, C2, C3, C4, GTX5 e GTX6)
- Toxins ASP: ácido domóico (DA e epi-DA)
- Outras toxinas: pectenotoxinas (PTX-1 e PTX-2)
Marcações: Central de Serviços CCMAR – ccmarcts@ualg.pt
Coordenador do nó – José Paulo da Silva