Enquanto Centro de Ciências do Mar, promovemos de forma ativa as Áreas Marinhas Protegidas (AMP) como uma ferramenta de gestão. Os nossos objetivos são:

• Criar um novo sistema internacional de classificação de Áreas Marinhas Protegidas;
• Promover novas AMPs que envolvam uma forte componente de participação das partes interessadas;
• Melhorar os sistemas de informação e monitorização das várias AMP (por exemplo, PNSACV, PMLS, PNRF)
• E estabelecer uma rede nacional de AMPs.

Para além disso, o trabalho que estamos no mapeamento das atividades humanas, visa incluir este tipo de dados no processo de ordenamento do espaço marinho e desta forma permitir o estabelecimento de AMPs mais eficazes e uma melhor integração de novas atividades marítimas, nomeadamente aquacultura offshore e energias renováveis.